《清洁工》的故事围绕着柬埔寨裔菲律宾医生托尼・德・拉・罗萨展开。托尼曾是马尼拉一家顶级医院的外科医生，医术精湛。然而，命运的重击降临，她年仅五岁的儿子卢卡被诊断出患有一种罕见且危及生命的疾病，只有在美国拉斯维加斯才能接受最先进的骨髓治疗。为了拯救儿子，托尼毅然决然踏上赴美之路，即便她的签证最终过期，成为了一名非法滞留者。​

         为筹医疗费，托尼放下身段，与嫂子菲奥娜一起做清洁工作。儿子因免疫系统脆弱，被藏在昏暗出租屋与外界隔离，看着儿子日渐消瘦，托尼内心满是煎熬，却从未放弃。​

         一次在赌场工作时，托尼目睹好友西奥因操纵拳击赛失败被枪杀。情急之下，她提出清理现场，凭医学知识抹去痕迹，这引起黑帮分子阿尔曼・莫拉莱斯注意。阿尔曼利用托尼非法移民身份和儿子的医疗费相要挟，逼她为犯罪组织效力，处理现场并救治受伤成员，托尼为儿子无奈应允。​

         在黑帮中，托尼凭才智站稳脚跟。一次火拼后，她在简陋环境下用有限资源救活重伤成员，获阿尔曼信任，但也深知处境危险。​

         FBI 探员加勒特・米勒盯上托尼，以遣返相逼要她配合调查。托尼陷入两难，最终为儿子决定冒险周旋。​

         深入黑帮核心后，托尼发现阿尔曼计划大规模毒品交易，决心阻止。她巧妙收集证据，加密传给加勒特。阿尔曼手下察觉异样并监视她，托尼佯装热情参与交易，打消疑虑。​